RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 CALN1Q9BXU9 219 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 GAREM1Q9H706 876 aa23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A1W2PQ67 120 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 SPINT1O43278 529 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGA12O60330 932 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNK5O95279 499 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ABL2P42684 1182 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TAZQ16635 292 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 MAML1Q92585 1016 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 MGME1Q9BQP7 344 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 SNX11Q9Y5W9 270 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 CFAP69A5D8W1 941 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TLR4O00206 839 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 WNT9AO14904 365 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 INSIG1O15503 277 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 PJA2O43164 708 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TIMP2P16035 220 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 MX2P20592 715 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 CCNCP24863 283 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 RGRP47804 291 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 RXRGP48443 463 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC9A4Q6AI14 798 aa23.53■■□□□ 1.36
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CTDSP2-203ENST00000547701 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 BBS5Q8N3I7 341 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 DENND6BQ8NEG7 585 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC17A9Q9BYT1 436 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR27Q9NS67 375 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ALG6Q9Y672 507 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 MUSKO15146 869 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 YKT6O15498 198 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 PSTPIP1O43586 416 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDH8O95206 1070 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 C21orf59P57076 290 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 ELP6Q0PNE2 266 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 STAT4Q14765 748 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 AGERQ15109 404 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 UGP2Q16851 508 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM52BQ4KMG9 183 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 PPM1JQ5JR12 505 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CTDSP2-203ENST00000547701 HDAC11Q96DB2 347 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 NUDCD1Q96RS6 583 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 TM7SF3Q9NS93 570 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-203ENST00000547701 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 MFSD11O43934 449 aa23.51■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 CES1P23141 567 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SERPINA4P29622 427 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 AKT2P31751 481 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 NXPH1P58417 271 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 FGL2Q14314 439 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 UAP1L1Q3KQV9 507 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 MARC1Q5VT66 337 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.51■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.51■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 MATN3O15232 486 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 SOCS5O75159 536 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 ADRB1P08588 477 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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CTDSP2-203ENST00000547701 GLRX5Q86SX6 157 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PLD5Q8N7P1 536 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 IFT43Q96FT9 208 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 GDF3Q9NR23 364 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 DTLQ9NZJ0 730 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-203ENST00000547701 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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