RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540609.5

ZNF10-208, Transcript of zinc finger protein 10, human

TSL 3

Gene ZNF10, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF10-208	ENST00000540609	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	TCEA2	Q15560	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	PDILT	Q8N807	584 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	PIK3R2	O00459	728 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	AREL1	O15033	823 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	CLDN11	O75508	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	FURIN	P09958	794 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	RGS7	P49802	495 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	ENPEP	Q07075	957 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	ITM2B	Q9Y287	266 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	NR3C1	P04150	777 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	THRA	P10827	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	VDR	P11473	427 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	F8A1	P23610	371 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	STAT5A	P42229	794 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	TESK1	Q15569	626 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	POLH	Q9Y253	713 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ZNF10-208	ENST00000540609	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	PDXK	O00764	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	NEMP1	O14524	444 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	CBX6	O95503	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	DLGAP3	O95886	979 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	NFATC4	Q14934	902 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	LINGO4	Q6UY18	593 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	MUC3B	Q9H195	1237 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	PDC	P20941	246 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	HTR1B	P28222	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	GPR3	P46089	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	MC2R	Q01718	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	DPYD	Q12882	1025 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	MAP7	Q14244	749 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	IRF4	Q15306	451 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ZNF10-208	ENST00000540609	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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