RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA4P22459 653 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 WNT3AP56704 352 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPK1Q13546 671 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PCLAFQ15004 111 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 UGP2Q16851 508 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMC3Q5W041 872 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 NT5MQ9NPB1 228 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS45Q9NRW7 570 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 COPG2Q9UBF2 871 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 GREM1O60565 184 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 RAMP2O60895 175 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINE1P05121 402 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCGP05129 697 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 EPCAMP16422 314 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 GRK2P25098 689 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CCR2P41597 374 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SGSHP51688 502 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ITKQ08881 620 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP15Q460N3 678 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM237Q96Q45 408 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOJQ9H4E5 214 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 F5H5T6 163 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 VAPBO95292 243 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CBX6O95503 412 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 HDCP19113 662 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC11A2P49281 568 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 KDELC1Q6UW63 502 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR22Q99680 433 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CORO1BQ9BR76 489 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 WWP1Q9H0M0 922 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO9BQ13459 2157 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PRU2 124 aa20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PACSIN3-211ENST00000539589 ABCG1P45844 678 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC1A6P48664 564 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPKAPK2P49137 400 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVK-21P61565 698 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PCSK7Q16549 785 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX26Q8N6G2 289 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CERS4Q9HA82 394 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 E2F8A0AVK6 867 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BNC9 293 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PER2O15055 1255 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V1G2O95670 118 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 KITP10721 976 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1E1P30953 314 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TNK2Q07912 1038 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 IL10RBQ08334 325 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 GRM3Q14832 879 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC14AQ86T13 490 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ABHD8Q96I13 439 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF358Q9NW07 568 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 TLK1Q9UKI8 766 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 CPQQ9Y646 472 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 REV3LO60673 3130 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL4P12829 197 aa20.44■□□□□ 0.86
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