RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 NEU3Q9UQ49 428 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ACOT9Q9Y305 439 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MAGEB16A2A368 324 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 E9PBE3 544 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 KLHL41O60662 606 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PLIN3O60664 434 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 DCTN3O75935 186 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 C8AP07357 584 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 KRT16P08779 473 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 17.9
PTPRK-216ENST00000524481 MYOGP15173 224 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TSHRP16473 764 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SERPINB8P50452 374 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SERINC3Q13530 473 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PEX6Q13608 980 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MFN1Q8IWA4 741 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM199Q8N511 208 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MARK4Q96L34 752 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf74Q96LT6 269 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TSGA13Q96PP4 275 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 GPAMQ9HCL2 828 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 DONSONQ9NYP3 566 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NUMBLQ9Y6R0 609 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 LCHNA4D1U4 455 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TGM5O43548 720 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TLL1O43897 1013 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CHRNGP07510 517 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ALADP13716 330 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PAX3P23760 479 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CTNNB1P35222 781 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 LIMK2P53671 638 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 RHOAP61586 193 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NTHL1P78549 312 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MANEALQ5VSG8 457 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NAPRTQ6XQN6 538 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 HIPK4Q8NE63 616 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MCUR1Q96AQ8 359 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM175Q9BSA9 504 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 HIDE1A8MVS5 230 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TIMM44O43615 452 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC166P0CW27 439 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 FMO4P31512 558 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NDST2P52849 883 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 NCALDP61601 193 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ADGRF1Q5T601 910 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 RANBP10Q6VN20 620 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 XPR1Q9UBH6 696 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 FETUBQ9UGM5 382 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TBX21Q9UL17 535 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 FCHO1O14526 889 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CD151P48509 253 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 RASA2Q15283 850 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 C10orf82Q8WW14 230 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 TLE6Q9H808 572 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 COPG2Q9UBF2 871 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 RAD54BQ9Y620 910 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 MEI4A8MW99 385 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 GYG2O15488 501 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 PSMD3O43242 534 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 ALDH1A2O94788 518 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRK-216ENST00000524481 FGBP02675 491 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms