RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523182.5

RAB11FIP1-205, Transcript of RAB11 family interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB11FIP1, Length 2,329 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ACTR3P61158 418 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PRKAA1Q13131 559 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GPR17Q13304 367 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 LHX8Q68G74 356 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 RAET1EQ8TD07 263 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CALML6Q8TD86 181 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CASD1Q96PB1 797 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MARCH5Q9NX47 278 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 HCSTQ9UBK5 93 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 A0A087X1B8 175 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NBNO60934 754 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 VNN2O95498 520 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GLDCP23378 1020 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 HOXD10P28358 340 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 OR1E1P30953 314 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ETFBP38117 255 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 VHLP40337 213 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 SLC11A1P49279 550 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 HK2P52789 917 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NOGQ13253 232 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PGBD5Q8N414 524 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NRG4Q8WWG1 115 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 SPATA17Q96L03 361 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NDNQ99608 321 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NUMBP49757 651 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 RING1Q06587 406 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 TNK2Q07912 1038 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 IL10RBQ08334 325 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 DUSP4Q13115 394 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 SERINC3Q13530 473 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NAA25Q14CX7 972 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PARP15Q460N3 678 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 RTP2Q5QGT7 225 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 LSMEM2Q8N112 164 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 YY1AP1Q9H869 796 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MROH6A6NGR9 719 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ARVCFO00192 962 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GRID2O43424 1007 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 EPHA3P29320 983 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ACVRL1P37023 503 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 KLF10Q13118 480 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GPNMBQ14956 572 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MUM1Q2TAK8 710 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 FUT10Q6P4F1 479 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 TADA1Q96BN2 335 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 OLFM1Q99784 485 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 NEMP1O14524 444 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 TLR5O60602 858 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 COX4I1P13073 169 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PRDX6P30041 224 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 PBX3P40426 434 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ERFP50548 548 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ASPHQ12797 758 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 CSHL1Q14406 222 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP1-205ENST00000523182 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms