RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SOGA1	O94964	1423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		A8MZ25	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		H0YAE9	185 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	LIAS	O43766	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PMPCB	O75439	489 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMD10	O75832	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NXPH3	O95157	252 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FTCD	O95954	541 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKCG	P05129	697 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBB	P07437	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GALT	P07902	379 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SELL	P14151	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	AVPR2	P30518	371 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FMO4	P31512	558 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	STAT2	P52630	851 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MVD	P53602	400 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	PCLAF	Q15004	111 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZWC4	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.15	□□□□□ -1.74
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0U1RQK1	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PQM1	296 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CHL1	O00533	1208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2C1	O95371	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	BMP15	O95972	392 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP3A4	P08684	503 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC175	P0C221	793 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ARSA	P15289	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GABRB1	P18505	474 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADRA1D	P25100	572 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GRIA3	P42263	894 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HDAC4	P56524	1084 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXL2	P58012	376 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	E2F1	Q01094	437 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	COASY	Q13057	564 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR162	Q16538	588 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTA3	Q16772	222 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.15	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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