RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 PGGT1BP53609 377 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM27E3Q08E93 113 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TAF11Q15544 211 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 BAK1Q16611 211 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ESCO2Q56NI9 601 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRILQ7L0X0 811 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 NOXA1Q86UR1 476 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 RBFAQ8N0V3 343 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TEX45Q8NA69 505 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 BICD2Q8TD16 824 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ERGIC1Q969X5 290 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 WACQ9BTA9 647 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 DCLK3Q9C098 648 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 PREBQ9HCU5 417 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM51Q9NW97 253 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 SARDHQ9UL12 918 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 GAGE10A6NGK3 116 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 EBAG9O00559 213 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TIMM23O14925 209 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 LDLRAD4O15165 306 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 OAZ2O95190 189 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 F9P00740 461 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 GNLYP22749 145 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ITGB8P26012 769 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 RYKP34925 604 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 KRT9P35527 623 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 CASP6P55212 293 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 GRIK3Q13003 919 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ITGADQ13349 1161 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 NAXEQ8NCW5 288 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 IL17REQ8NFR9 667 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 KLHL29Q96CT2 875 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 TXNDC15Q96J42 360 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-685P-201ENST00000517088 LINC01553A4QN01 128 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 J3KR12 359 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 J3KRW8 73 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 INSIG1O15503 277 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 ASAP2O43150 1006 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 TNFSF14O43557 240 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCNAP12004 261 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTPN2P17706 415 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 ELF1P32519 619 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 MLH1P40692 756 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 GNAQP50148 359 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 NUDT6P53370 316 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 NAA35Q5VZE5 725 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 FJX1Q86VR8 437 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 NEUROG1Q92886 237 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-685P-201ENST00000517088 MIB2Q96AX9 1013 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms