RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC8DQ7L1W4 858 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PALB2Q86YC2 1186 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TDRPQ86YL5 185 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMC8Q8IU68 726 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXL14Q8N1E6 418 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJC3Q8NFK1 279 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADAMTS15Q8TE58 950 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPM1EQ8WY54 764 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZUFSPQ96AP4 578 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SH3KBP1Q96B97 665 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 EVI5LQ96CN4 794 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF183Q96D59 192 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL15Q96M94 604 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TKTL2Q9H0I9 626 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDT1Q9H211 546 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIPK2Q9H2X6 1198 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM51Q9NW97 253 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIAA1456Q9P272 454 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDP2Q9P2J9 529 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJD2Q9UKL4 321 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FZD10Q9ULW2 581 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A0U1RQF3 1178 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHL1O00533 1208 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 VWA5AO00534 786 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 EBAG9O00559 213 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPTLC2O15270 562 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC28A2O43868 658 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLK8O60259 260 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MMP3P08254 477 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF12P17014 697 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ITGAXP20702 1163 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MLH1P40692 756 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 COMPP49747 757 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 BLKP51451 505 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT6P53370 316 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDR1Q08345 913 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGEF6Q15052 776 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TADA2BQ86TJ2 420 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 FJX1Q86VR8 437 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CERS3Q8IU89 383 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC105Q8IYK2 499 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTROBQ8N137 903 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNIP2Q8NFZ5 429 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM170AQ8WVE7 144 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMED6Q8WW62 240 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF1BPQ96EK5 621 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TXNDC15Q96J42 360 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 BBS4Q96RK4 519 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 WASH6PQ9NQA3 447 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYSLTR2Q9NS75 346 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIF1ANQ9NWT6 349 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLK2Q9NYY3 685 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBX20Q9UMR3 447 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CAMK2AQ9UQM7 478 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 DYTNA2CJ06 578 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLEC18AA5D8T8 446 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 LACTBL1A8MY62 500 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFSF14O43557 240 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 GUCY1B2O75343 617 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-344P-201ENST00000516635 F9P00740 461 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms