RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMPRSS15P98073 1019 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 WSCD2Q2TBF2 565 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACSM6Q6P461 480 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFAP2EQ6VUC0 442 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRGPRDQ8TDS7 321 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF333Q96JL9 665 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 HES7Q9BYE0 225 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RXFP3Q9NSD7 469 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM30AQ9NV96 361 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM51Q9NW97 253 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLCL2Q9UPR0 1127 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLHQ9Y253 713 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFSF13BQ9Y275 285 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMTK3Q96Q04 1460 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 A6NL46 340 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 H7C4K7 107 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PANO1I0J062 215 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGS10O43665 173 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 AIREO43918 545 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFS7O75251 213 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 THP07101 528 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGKQP52824 942 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARFIP2P53365 341 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVK-21P61565 698 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHC2P98077 582 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHAGQ02094 409 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MECOMQ03112 1051 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTBP1Q13363 440 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LY6DQ14210 128 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLS1Q14651 629 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 NECTIN1Q15223 517 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTCAP3Q53RY4 240 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNNM4Q6P4Q7 775 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZSR9 355 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf96Q7Z7L8 435 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KMT5CQ86Y97 462 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBFAQ8N0V3 343 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM217Q8N7C4 229 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF611Q8N823 705 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8N9L7 120 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUN3Q8TAQ9 357 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRAPQ8TCY5 172 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 JADE3Q92613 823 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ESAMQ96AP7 390 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZDHHC12Q96GR4 267 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRWD1Q9UFC0 647 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACAD8Q9UKU7 415 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC22A2O15244 555 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASNSP08243 561 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3R1P27986 724 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHRNA5P30532 468 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCTDP32321 178 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITGA8P53708 1063 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUT7Q11130 342 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAGE5Q13069 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAGE6Q13070 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAT4Q14765 748 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1644Q3SXP7 199 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT79Q5XKE5 535 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM74Q86UV6 250 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM73Q86UV7 250 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGFN1Q86VF2 1251 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPM1KQ8N3J5 372 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIPOL1Q8TD10 442 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CREB3L4Q8TEY5 395 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGEF26Q96DR7 871 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRFN5Q96NI6 719 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYT15Q9BQS2 421 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPH1Q9BZG8 443 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 WNT5BQ9H1J7 359 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PANK3Q9H999 370 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMBRD1Q9NUN5 540 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNPOQ9NVS9 261 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL17CQ9P0M4 197 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIRPGQ9P1W8 387 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHA6Q9UN73 950 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM75PA6NK02 468 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLCO1B7G3V0H7 640 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO1CO00159 1063 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms