RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 APOA5Q6Q788 366 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRUNE1Q86TP1 453 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP4K3Q8IVH8 894 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GIPC3Q8TF64 312 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 UCMAQ8WVF2 138 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 WNT8BQ93098 351 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OMA1Q96E52 524 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CRB3Q9BUF7 120 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SYTL2Q9HCH5 934 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM114A2Q9NRY5 505 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT19A8MXV4 375 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCRL2O00421 344 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PER2O15055 1255 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 BET1O15155 118 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNN4O15554 427 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 XYLBO75191 536 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A3O75751 556 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TBX18O95935 607 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA4P13612 1032 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NPY2RP49146 381 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NPEPPSP55786 919 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN5P62079 268 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PTH1RQ03431 593 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 THEM4Q5T1C6 240 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CASC4Q6P4E1 433 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DEGS2Q6QHC5 323 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCK1Q86TW2 530 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR156Q8NFN8 814 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FBF1Q8TES7 1133 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF21AQ96BD5 680 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RANBP9Q96S59 729 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCG8Q9H221 673 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 STK17AQ9UEE5 414 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC26A0AVF1 554 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 H7C0S8 307 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS13O14921 159 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SNAPINO95295 136 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SNAP29O95721 258 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CNTFP26441 200 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 G0S2P27469 103 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC25BP30305 580 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP14P31944 242 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DGKGP49619 791 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCN5P51795 746 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMC5P62195 406 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TAP2Q03519 686 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GRM3Q14832 879 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.675e-6■■■□□ 18.2
RABGGTB-213ENST00000496055 LIN52Q52LA3 116 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MPP5Q8N3R9 675 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DACH2Q96NX9 599 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms