RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 IGHV4-34P06331 123 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF806P0C7X5 589 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ADRB3P13945 408 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CCNB1P14635 433 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GKP32189 559 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NUDT1P36639 197 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PTGER3P43115 390 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MMP13P45452 471 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RGRP47804 291 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MARCKSL1P49006 195 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SCNN1BP51168 640 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SUOXP51687 545 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NEK3P51956 506 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ADPRHP54922 357 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TAS2R38P59533 333 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 AP1S1P61966 158 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CNTN1Q12860 1018 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 XRCC4Q13426 336 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CSRP2Q16527 193 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LPAL2Q16609 132 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 KAZNQ674X7 775 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NPNTQ6UXI9 565 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 BBS12Q6ZW61 710 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SRLQ86TD4 932 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 FAM124AQ86V42 546 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZSCAN30Q86W11 494 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TRIM69Q86WT6 500 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PGBD5Q8N414 524 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DEFB119Q8N690 84 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CNTD1Q8N815 330 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CCNYQ8ND76 341 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TRIM58Q8NG06 486 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CEP76Q8TAP6 659 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 GANCQ8TET4 914 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ASB12Q8WXK4 309 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 BIRC7Q96CA5 298 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LGMNQ99538 433 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 IL12RB2Q99665 862 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 LZTFL1Q9NQ48 299 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 DYRK4Q9NR20 520 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 VPS45Q9NRW7 570 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 HAUS2Q9NVX0 235 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 NCDNQ9UBB6 729 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.44□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1W2PPC4 97 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 CFAP69A5D8W1 941 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 PLK4O00444 970 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 AREL1O15033 823 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MTSS1O43312 755 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 TSPAN6O43657 245 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 FZD6O60353 706 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 SOCS5O75159 536 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 WFS1O76024 890 aa5.43□□□□□ -1.54
SRPRB-205ENST00000494297 MAP3K6O95382 1288 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms