RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 AIF1P55008 147 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf87Q6PH81 154 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 NTAN1Q96AB6 310 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 GBA3Q9H227 469 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 NDE1Q9NXR1 346 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 NME7Q9Y5B8 376 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 CLUHO75153 1309 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM13O60858 407 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 VPS26AO75436 327 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 KATNA1O75449 491 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HIST1H2ADP20671 130 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ARL10Q8N8L6 244 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ASB8Q9H765 288 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SUN2Q9UH99 717 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 H0YGN5 161 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 CLDN11O75508 207 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP6AP2O75787 350 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 CCNCP24863 283 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HMOX2P30519 316 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PCYT1AP49585 367 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 USP4Q13107 963 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 RASA2Q15283 850 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SYTL3Q4VX76 610 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF148Q8N7C7 305 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 BADQ92934 168 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SLCO2A1Q92959 643 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 MIEF2Q96C03 454 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 LRGUKQ96M69 825 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM165Q9HC07 324 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 NFS1Q9Y697 457 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 C2orf78A6NCI8 922 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 RFPL2O75678 378 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PIGNO95427 931 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 UGT2B4P06133 528 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TPSB2P20231 275 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ITGALP20701 1170 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 IL4RP24394 825 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 POU4F1Q01851 419 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 GRM3Q14832 879 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TPSAB1Q15661 275 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 MARK4Q96L34 752 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 XPR1Q9UBH6 696 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 BTN3A1O00481 513 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 CNTFP26441 200 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 RGS4P49798 205 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAM17P78536 824 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 PFKFB4Q16877 469 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 IGSF8Q969P0 613 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 HAPLN3Q96S86 360 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 SCML2Q9UQR0 700 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 KCTD3Q9Y597 815 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 INPPL1O15357 1258 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 TBC1D4O60343 1298 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRVP-201ENST00000482597 ZMPSTE24O75844 475 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms