RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479155.1

LLGL1-202, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LLGL1, Length 6,004 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-202ENST00000479155 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 VPS4AQ9UN37 437 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 BTRCQ9Y297 605 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 NRF1Q16656 503 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 TTMPQ5BVD1 217 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 A0A087WXM4 84 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 CLDN5O00501 218 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 STX11O75558 287 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 IL1BP01584 269 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 EXO5Q9H790 373 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 BRD9Q9H8M2 597 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 CHKBQ9Y259 395 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.56□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 COX4I1P13073 169 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ITGAXP20702 1163 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ABRQ12979 859 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 PSMD5Q16401 504 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ALG11Q2TAA5 492 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 AADATQ8N5Z0 425 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 KLHL31Q9H511 634 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 URADA6NGE7 173 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ULK1O75385 1050 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ABHD2P08910 425 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 CTPS1P17812 591 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 RHBDL3P58872 404 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 EPS8Q12929 822 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 PTPRNQ16849 979 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 CNSTQ6PJW8 725 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 BTBD9Q96Q07 612 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MST1RQ04912 1400 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 PDE9AO76083 593 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 RGS1Q08116 209 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 TAF5Q15542 800 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ART4Q93070 314 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MRIQ9BWK5 157 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 KLHL18O94889 574 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GRIA3P42263 894 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MTAPQ13126 283 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 PMF1Q6P1K2 205 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GPR156Q8NFN8 814 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.55□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 GRM5P41594 1212 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MAXP61244 160 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SP3Q02447 781 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 TNK2Q07912 1038 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 MZT2AQ6P582 158 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 B4GALT5O43286 388 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 OTCP00480 354 aa14.54□□□□□ -0.08
LLGL1-202ENST00000479155 ERBB2P04626 1255 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms