RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TXNDC15Q96J42 360 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 WNT16Q9UBV4 365 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.06□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 LINC01553A4QN01 128 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HSPB2A8KAH6 182 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 KLRF2D3W0D1 207 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 J3KR12 359 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 RGS11O94810 467 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GLUD1P00367 558 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GLUD2P49448 558 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CLDN2P57739 230 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HSPB2Q16082 182 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PDXDC1Q6P996 788 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TMED6Q8WW62 240 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HTRA1Q92743 480 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 EVPLQ92817 2033 aa7.05□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GVM2 712 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 C4orf47A7E2U8 309 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CCKBRP32239 447 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 MXI1P50539 228 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 EFNA5P52803 228 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PLCB4Q15147 1175 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GJC3Q8NFK1 279 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 APOPT1Q96IL0 206 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 FUZQ9BT04 418 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TBX20Q9UMR3 447 aa7.04□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 DYTNA2CJ06 578 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TACC1O75410 805 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 GALTP07902 379 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PTPN2P17706 415 aa7.03□□□□□ -1.28
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SGCE-210ENST00000472326 GPR68Q15743 365 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ESCO2Q56NI9 601 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 ESX1Q8N693 406 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1456Q9P272 454 aa7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 IFNL4K9M1U5 179 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 KCNJ13O60928 360 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SERPINI2O75830 405 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 FMO4P31512 558 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 PIGAP37287 484 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TAF11Q15544 211 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 DCAF6Q58WW2 860 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 TRIB2Q92519 343 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.02□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ZNF12P17014 697 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 POU1F1P28069 291 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 NR1H2P55055 460 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 UFM1P61960 85 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 ST3GAL1Q11201 340 aa7.01□□□□□ -1.29
SGCE-210ENST00000472326 VEPH1Q14D04 833 aa7.01□□□□□ -1.29
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