RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX12Q9BXU0 123 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 NUF2Q9BZD4 464 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PDE7BQ9NP56 450 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF146Q9NTX7 359 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 UTYO14607 1347 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 AOX1Q06278 1338 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A096LPK6 155 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 MATN3O15232 486 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A17O43808 307 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFS3O75489 264 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CSPG5O95196 566 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GABRB1P18505 474 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 BMP5P22003 454 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PROZP22891 400 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 CIITAP33076 1130 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC16A2P36021 539 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 F2RL1P55085 397 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 LRMPQ12912 555 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PKP1Q13835 747 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RUNX2Q13950 521 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 RASA2Q15283 850 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SHBQ15464 509 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 JADE1Q6IE81 842 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 TDRPQ86YL5 185 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-207ENST00000470201 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC01548A6NM66 108 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPB2A8KAH6 182 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 BTBD18B2RXH4 712 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 F8W810 466 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC14L5O43304 696 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HCRTR2O43614 444 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ENTPD3O75355 529 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PROP1O75360 226 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A12O75746 678 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SAT1P21673 171 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TFF2Q03403 129 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CFHR1Q03591 330 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIK3Q13003 919 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMD6Q15008 389 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPB2Q16082 182 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NTRK2Q16620 822 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SPECC1Q5M775 1068 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM57BQ71RH2 274 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINA11Q86U17 422 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX11Q8IYF3 940 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SCML4Q8N228 414 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF183Q96D59 192 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF711Q9Y462 761 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 INSL6Q9Y581 213 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 CCER2I3L3R5 266 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 TP73O15350 636 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAM20O43506 726 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 UGDHO60701 494 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 RAMP2O60895 175 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QL1O75973 258 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHB2P29323 1055 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms