RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 KLC3Q6P597 504 aa18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC30A9Q6PML9 568 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0408Q6ZU52 694 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SERINC5Q86VE9 423 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RNF135Q8IUD6 432 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 ALDH1A3P47895 512 aa18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 AGAP9Q5VTM2 703 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 FOXB2Q5VYV0 432 aa18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.49■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.49■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 PKNOX1P55347 436 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 CCDC126Q96EE4 140 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 PIDD1Q9HB75 910 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0U1RQF3 1178 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 PAX3P23760 479 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RENBPP51606 427 aa18.48■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MGAT3Q09327 533 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF10BO14763 440 aa18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 ME2P23368 584 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 RNF148Q8N7C7 305 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 CENPKQ9BS16 269 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 NMUR1Q9HB89 426 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SPC25Q9HBM1 224 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 NT5MQ9NPB1 228 aa18.47■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MRGBPQ9NV56 204 aa18.47■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CLCN5P51795 746 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SATB1Q01826 763 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF280DQ6N043 979 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.46■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 ADAM2Q99965 735 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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SYNE4-204ENST00000465425 CAPN8A6NHC0 703 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SDHDO14521 159 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC166P0CW27 439 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 POLE2P56282 527 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 CEACAM7Q14002 265 aa18.46■□□□□ 0.55
SYNE4-204ENST00000465425 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.46■□□□□ 0.55
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