RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006		A0A1W2PRG0	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	LIAS	O43766	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GOSR1	O95249	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	STMN1	P16949	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CPT2	P23786	658 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CIITA	P33076	1130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	KRT2	P35908	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GP5	P40197	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	STAT2	P52630	851 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	OAZ1	P54368	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MFAP4	P55083	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SCAMP1	O15126	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ONECUT2	O95948	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FES	P07332	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TUBB	P07437	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	POU1F1	P28069	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GSTM2	P28161	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC8A1	P32418	973 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP2C18	P33260	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	JAK3	P52333	1124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	BPIFB3	P59826	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	E2F5	Q15329	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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