RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 NPNTQ6UXI9 565 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM69Q86WT6 500 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FAF2Q96CS3 445 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SERAC1Q96JX3 654 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM14Q96QK8 99 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GAREM1Q9H706 876 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 POM121BA6NF01 834 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLON5A6NGN9 336 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 AREL1O15033 823 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 VILLO15195 856 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CBFA2T3O75081 653 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PALMO75781 387 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDH8O95206 1070 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SYPP08247 313 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TPM1P09493 284 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TNNT1P13805 278 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GM2AP17900 193 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CR2P20023 1033 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 COMTP21964 271 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CD38P28907 300 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN1A1P33908 653 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL4AP40617 200 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIA4P48058 902 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCKSL1P49006 195 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 NEK3P51956 506 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOAP61586 193 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GBE1Q04446 702 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT81Q14533 505 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PROX2Q3B8N5 592 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SRLQ86TD4 932 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HORMAD1Q86X24 394 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX26Q8N6G2 289 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SPC24Q8NBT2 197 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RFFLQ8WZ73 363 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 WNT2BQ93097 391 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF157Q96PX1 679 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PANX2Q96RD6 677 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PREBQ9HCU5 417 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 INTUQ9ULD6 942 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG6Q9Y672 507 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FRYQ5TBA9 3013 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 KNTC1P50748 2209 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP13Q12802 2813 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GTQ1 180 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR4O00206 839 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1G1O43747 822 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP20O60882 483 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 OPHN1O60890 802 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA10O95299 355 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IGSF6O95976 241 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT10P13645 584 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DESP17661 470 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK2P20155 84 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SDHBP21912 280 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP25P42331 645 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms