RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RANBP9Q96S59 729 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 COPS3Q9UNS2 423 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CLCA1A8K7I4 914 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 RAB13P51153 203 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 SERPINB11Q96P15 392 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 MED15Q96RN5 788 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 TWNKQ96RR1 684 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FAM129BQ96TA1 746 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF251Q9BRH9 671 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 POLE4Q9NR33 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 OR14I1A6ND48 311 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CHP2O43745 196 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IL18RAPO95256 599 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GGPS1O95749 300 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 NOS2P35228 1153 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA11P43364 429 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 Q5PR19 223 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GRTP1Q5TC63 336 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 AP2M1Q96CW1 435 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 CD300AQ9UGN4 299 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 FRMPD4Q14CM0 1322 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 EMSYQ7Z589 1322 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 A0A088AWK7 358 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 KLRF2D3W0D1 207 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 M0R233 179 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A1O15245 554 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SCO1O75880 301 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FHP07954 510 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VEGFCP49767 419 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 STAT5BP51692 787 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 BMXP51813 675 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 AQP5P55064 265 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GIT2Q14161 759 aa5.63□□□□□ -1.51
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