RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf74Q96LT6 269 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 STIM2Q9P246 746 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ATRXP46100 2492 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 H3BM21 787 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 AK5Q9Y6K8 562 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 PLK4O00444 970 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TPP1O14773 563 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 KRT14P02533 472 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 GYPCP04921 128 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 AGBL4Q5VU57 503 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 TFR2Q9UP52 801 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 A6NHS1 94 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRR-204ENST00000440835 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF185O15231 689 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 OPA1O60313 960 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 TCEA3O75764 348 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 MT-CO3P00414 261 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NAT2P11245 290 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 NOS2P35228 1153 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 ABL2P42684 1182 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RANBP1P43487 201 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRR-204ENST00000440835 RGS7P49802 495 aa6.12□□□□□ -1.43
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