RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHRNGP07510 517 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF789Q5FWF6 425 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARMC3Q5W041 872 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPGNQ6UW88 154 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIAA0408Q6ZU52 694 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 CALML6Q8TD86 181 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 TADA1Q96BN2 335 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPR78Q96P69 363 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEMA3CQ99985 751 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 DRC3Q9H069 523 aa25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 TARM1B6A8C7 271 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 POU4F1Q01851 419 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDNQ99608 321 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 OMDQ99983 421 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGEC1O60732 1142 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRAMEF11O60813 436 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKAA2P54646 552 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAGLUP54802 743 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCL23P55773 120 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC43Q8N309 656 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 NACA2Q9H009 215 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCLRE1BQ9H816 532 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLA2G4CQ9UP65 541 aa25.48■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A087X1B8 175 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNAZP19086 355 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MPSTP25325 297 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC6A4P31645 630 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCR10P46092 362 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTA1Q13330 715 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF235Q14590 738 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNAL1Q4LDG9 190 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAPK15Q8TD08 544 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDR60Q8WVS4 1066 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM161BQ96MY7 647 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAP2CQ9Y3L5 183 aa25.47■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCN5AQ14524 2016 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCL22O00626 93 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MUSKO15146 869 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 DLX3O60479 287 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR1D2P34982 312 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACSBG2Q5FVE4 666 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 POU5F2Q8N7G0 328 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1orf21Q9H246 121 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCM8Q9UJA3 840 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A0D9SEW6 157 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MROH6A6NGR9 719 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 MEI4A8MW99 385 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACSL4O60488 711 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 UPP2O95045 317 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFT43Q96FT9 208 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 THTPAQ9BU02 230 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.46■■□□□ 1.67
PLEKHF1-201ENST00000436066 FKTNO75072 461 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 GJB5O95377 273 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIGNO95427 931 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPSAP08865 295 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAP1GDS1P52306 607 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMC7Q7Z402 723 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 HEXDCQ8WVB3 486 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 HDAC10Q969S8 669 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDFQ9HBH1 243 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTRRQ9UBK8 725 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCTD3Q9Y597 815 aa25.45■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC7A4O43246 635 aa25.44■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL14P50914 215 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARSDP51689 593 aa25.44■■□□□ 1.66
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