RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC25A27	O95847	323 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FOLH1	Q04609	750 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PHC3	Q8NDX5	983 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	GPR182	O15218	404 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	JCHAIN	P01591	159 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CYP2C18	P33260	490 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CSH1	P0DML2	217 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CSH2	P0DML3	217 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ABCC3	O15438	1527 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	EVPL	Q92817	2033 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CBX6	O95503	412 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CKB	P12277	381 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PRDX6	P30041	224 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TOMM20	Q15388	145 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SNX3	O60493	162 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	HUNK	P57058	714 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26	1e-7	■■■■□ 25.4
NCOR2-208	ENST00000429285	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SCNN1B	P51168	640 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RFK	Q969G6	155 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26	7e-7	■■■■□ 22.3
NCOR2-208	ENST00000429285	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	APOC2	P02655	101 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CKM	P06732	381 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	EPHB3	P54753	998 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285		M0QX08	132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SGPL1	O95470	568 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PRH1	P02810	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SPIB	Q01892	262 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF613	Q6PF04	617 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TRIM38	O00635	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	NFKB1	P19838	968 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CLCN2	P51788	898 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CEBPG	P53567	150 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TTC3	P53804	2025 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	URAD	A6NGE7	173 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RAMP2	O60895	175 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SIN3B	O75182	1162 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC6A2	P23975	617 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CBX4	O00257	560 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FES	P07332	822 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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