RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-210ENST00000428861 SLC14A1Q13336 389 aa10.84□□□□□ -0.67
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ATG4B-210ENST00000428861 PTPRRQ15256 657 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 SPA17Q15506 151 aa10.84□□□□□ -0.67
ATG4B-210ENST00000428861 TAZQ16635 292 aa10.84□□□□□ -0.67
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