RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM74Q86UV6 250 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM73Q86UV7 250 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TDRPQ86YL5 185 aa2.57□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.56□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 FSD2A1L4K1 749 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 GAGE12JA6NER3 117 aa2.55□□□□□ -2
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