RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DRC3Q9H069 523 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G4CQ9UP65 541 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEC1O60732 1142 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF11O60813 436 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNGP07510 517 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNAZP19086 355 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIA4P48058 902 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU4F1Q01851 419 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLG1Q12959 904 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP157Q5JU67 520 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC43Q8N309 656 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NXNL1Q96CM4 212 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOCOSQ96EN8 888 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf21Q9H246 121 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROH6A6NGR9 719 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F5H5T6 163 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0Y3Z8 333 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNG1P51959 295 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAP1GDS1P52306 607 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAL1Q4LDG9 190 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGI2Q8N0V4 545 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCLYQ96I15 445 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OMDQ99983 421 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCLRE1BQ9H816 532 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSS2Q9NR19 701 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.87■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087X1B8 175 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJB3O75712 270 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC12A2P55011 1212 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSBG2Q5FVE4 666 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGR3Q8TD06 166 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK15Q8TD08 544 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR60Q8WVS4 1066 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMA3CQ99985 751 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDFQ9HBH1 243 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAP2CQ9Y3L5 183 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUSKO15146 869 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLX3O60479 287 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MPSTP25325 297 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A4P31645 630 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUMBP49757 651 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAGLUP54802 743 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf22Q49AR2 442 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM161BQ96MY7 647 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDNQ99608 321 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTRRQ9UBK8 725 aa18.86■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC7A4O43246 635 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSL4O60488 711 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TM7SF2O76062 418 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPOXP36551 454 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCR10P46092 362 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLCN5P51795 746 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MXRA7P84157 204 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF235Q14590 738 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT7Q86SF2 657 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CILP2Q8IUL8 1156 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLFM1Q99784 485 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0D9SEW6 157 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEI4A8MW99 385 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MATN2O00339 956 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LDB2O43679 373 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGNO95427 931 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFEMP2O95967 443 aa18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1D2P34982 312 aa18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms