RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 GNA12Q03113 381 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CYP4X1Q8N118 509 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PEX11BO96011 259 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TCF3P15923 654 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SERINC3Q13530 473 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PDK4Q16654 411 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PARP15Q460N3 678 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TMEM25Q86YD3 366 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 AGAP3Q96P47 875 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 RHOCP08134 193 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 GLDCP23378 1020 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CNTD1Q8N815 330 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SENP1Q9P0U3 644 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 DENND4AQ7Z401 1863 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TTC36A6NLP5 189 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 H0Y626 953 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MATN3O15232 486 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CCDC22O60826 627 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TMEM63AO94886 807 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CD68P34810 354 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZNF33AQ06730 810 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 FYB2Q5VWT5 728 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PID1Q7Z2X4 250 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 BBOF1Q8ND07 529 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MAML1Q92585 1016 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SMARCD2Q92925 531 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MSLNLQ96KJ4 702 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 FOXP3Q9BZS1 431 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PYGLP06737 847 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 IMPDH2P12268 514 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 WEE1P30291 646 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 KYNUQ16719 465 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MPPE1Q53F39 396 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TEX44Q53QW1 395 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CES5AQ6NT32 575 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PHC3Q8NDX5 983 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MYADMQ96S97 322 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MAGEH1Q9H213 219 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZFP69BQ9UJL9 534 aa24.72■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ILVBLA1L0T0 632 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA8MH3BSY2 632 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 OPHN1O60890 802 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 FCARP24071 287 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PSMB4P28070 264 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 COL19A1Q14993 1142 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TDRPQ86YL5 185 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ASIC4Q96FT7 647 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SPON2Q9BUD6 331 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 SP110Q9HB58 689 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 GDE1Q9NZC3 331 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TMCO1Q9UM00 188 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 RANBP1P43487 201 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 KCNJ11Q14654 390 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 TEKT5Q96M29 485 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 IL12RB2Q99665 862 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 CDH7Q9ULB5 785 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU1-201ENST00000421832 MTSS1O43312 755 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU1-201ENST00000421832 MAP3K7O43318 606 aa24.7■■□□□ 1.54
CTU1-201ENST00000421832 GSTT1P30711 240 aa24.7■■□□□ 1.54
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