RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 SLC39A10Q9ULF5 831 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 PADI4Q9UM07 663 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGAP10A1A4S6 786 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ACOT8O14734 319 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 KCTD11Q693B1 232 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 NXNQ6DKJ4 435 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 BORAQ6PGQ7 559 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 GALNT4Q8N4A0 578 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 CNTD1Q8N815 330 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TLK1Q9UKI8 766 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEB16A2A368 324 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 NAGLUP54802 743 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 LPIN1Q14693 890 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 KCNA10Q16322 511 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 CERCAMQ5T4B2 595 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TAC4Q86UU9 113 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 PKMYT1Q99640 499 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 GPR22Q99680 433 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ADAM2Q99965 735 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 NR1H2P55055 460 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 USP46P62068 366 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 PRKCZQ05513 592 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 GRM3Q14832 879 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM209Q96SK2 561 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 M0QZQ0 153 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 LRIG2O94898 1065 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 PPP2R5DQ14738 602 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ADRM1Q16186 407 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 HDAC11Q96DB2 347 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 DDHD2O94830 711 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 NPY2RP49146 381 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 GALNT2Q10471 571 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TUSC3Q13454 348 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 LSMEM2Q8N112 164 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 PREBQ9HCU5 417 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 PTPRDP23468 1912 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 VAPBO95292 243 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 JUNP05412 331 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 CD68P34810 354 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 SCML4Q8N228 414 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 STYXQ8WUJ0 223 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 SCYL1Q96KG9 808 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MARK4Q96L34 752 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 DSEQ9UL01 958 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MTSS1O43312 755 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 GBA3Q9H227 469 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM38O00635 465 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ITGB1P05556 798 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 HPCAP84074 193 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB17Q13105 803 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 RNF34Q969K3 372 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 RHOJQ9H4E5 214 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 GALNT8Q9NY28 637 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 THEGQ9P2T0 379 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PSMC3P17980 439 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 GLRBP48167 497 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 USP10Q14694 798 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 KLC3Q6P597 504 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PAOXQ6QHF9 649 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms