RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 DOCK4Q8N1I0 1966 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 ILVBLA1L0T0 632 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 BLACEA4D250 179 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 AREL1O15033 823 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 P4HA2O15460 535 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 DAB1O75553 588 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 TM7SF2O76062 418 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 CASRP41180 1078 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 CXCR3P49682 368 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 POLE2P56282 527 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC63Q05C16 580 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC31Q6UY01 552 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 PASD1Q8IV76 773 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 SFTPA2Q8IWL1 248 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 GPR156Q8NFN8 814 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C4Q8NGE1 309 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL32Q96NJ5 620 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 NPY6RQ99463 290 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 EPAS1Q99814 870 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 LRP4O75096 1905 aa19.54■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 TOR1BO14657 336 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 ERBB2P04626 1255 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 UGT2B4P06133 528 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 CD82P27701 267 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 C16orf72Q14CZ0 275 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 ENPP7Q6UWV6 458 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 GKN2Q86XP6 184 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 SLITRK4Q8IW52 837 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 FAM26EQ8N5C1 309 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA6CQ9H3T2 930 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 APPL1Q9UKG1 709 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 SDK2Q58EX2 2172 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 LRRK2Q5S007 2527 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 KRIT1O00522 736 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 SRGAP2O75044 1071 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 RASGRP1O95267 797 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 GNA12Q03113 381 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 IRF4Q15306 451 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 PHF19Q5T6S3 580 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD16Q68DU8 428 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF783Q6ZMS7 281 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 TTC7BQ86TV6 843 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 PLPP6Q8IY26 295 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 NKD1Q969G9 470 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf74Q96LT6 269 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 RMND1Q9NWS8 449 aa19.52■□□□□ 0.72
HOXD12-201ENST00000404162 CHD5Q8TDI0 1954 aa19.52■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 LRRK1Q38SD2 2015 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CCL4P13236 92 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 GLB1P16278 677 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ACVRL1P37023 503 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SULT1E1P49888 294 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PEX5P50542 639 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ARSDP51689 593 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A3Q01959 620 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 NCAPHQ15003 741 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SLC26A9Q7LBE3 791 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SPRED1Q7Z699 444 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf40AQ8TE69 158 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF26Q96DR7 871 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CEP63Q96MT8 703 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ANAPC2Q9UJX6 822 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 COQ6Q9Y2Z9 468 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.51■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 BECN2A8MW95 431 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 SRP54P61011 504 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 DEUP1Q05D60 604 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CERCAMQ5T4B2 595 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM164Q5U3C3 297 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 GJB7Q6PEY0 223 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 OGFOD3Q6PK18 319 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 DRC7Q8IY82 874 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 OR2AP1Q8NGE2 309 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TBCBQ99426 244 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 APOOQ9BUR5 198 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TUBD1Q9UJT1 453 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 STMND1H3BQB6 276 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 LIFP15018 202 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 PNLIPP16233 465 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 CCR10P46092 362 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXD12-201ENST00000404162 KRT85P78386 507 aa19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms