RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 OR13H1Q8NG92 308 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC42Q96M95 316 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 CALN1Q9BXU9 219 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD51BO15315 384 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PROSCO94903 275 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM253P0C7T8 217 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ITIH2P19823 946 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 BNIP3Q12983 259 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 MMRN1Q13201 1228 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 GRM3Q14832 879 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SARM1Q6SZW1 724 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SRLQ86TD4 932 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TSC1Q92574 1164 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM5Q9C035 493 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 KLK13Q9UKR3 277 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39-201ENST00000393537 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 A6NNZ2 444 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CD48P09326 243 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CSNK1DP48730 415 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZSR6 202 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CNGA4Q8IV77 575 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 BMFQ96LC9 184 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPAN11A1L157 253 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 POM121BA6NF01 834 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MUSKO15146 869 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFSF14O43557 240 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP20O60882 483 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SDC3O75056 442 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 IL4RP24394 825 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINB6P35237 376 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ARSEP51690 589 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TAS2R40P59535 323 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP58Q5T655 872 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 EID2Q8N6I1 236 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM71BQ8TC56 605 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ASB12Q8WXK4 309 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF599Q96NL3 588 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SEPT3Q9UH03 358 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 FPGTO14772 594 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SERPINA4P29622 427 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 RENBPP51606 427 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 SUOXP51687 545 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ELP6Q0PNE2 266 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 DPYSL3Q14195 570 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 UGP2Q16851 508 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD6Q8NC69 237 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PSKH2Q96QS6 385 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39-201ENST00000393537 ACACBO00763 2458 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms