RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR2A25A4D2G3 310 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GLOD5A6NK44 160 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMIM22K7EJ46 135 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HCRTR2O43614 444 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NDUFS3O75489 264 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSPA4LO95757 839 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IL7RP16871 459 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ITGAXP20702 1163 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CAMPP49913 170 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLCNKBP51801 687 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CACNA2D1P54289 1103 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CTSWP56202 376 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UBXN2AP68543 259 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GRIK3Q13003 919 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNFAIP1Q13829 316 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KYNUQ16719 465 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 Q6ZPA2 131 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VSIG1Q86XK7 387 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 APOL6Q9BWW8 343 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MRGBPQ9NV56 204 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PADI1Q9ULC6 663 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UTYO14607 1347 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AOX1Q06278 1338 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSPB2A8KAH6 182 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLRF2D3W0D1 207 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC25A12O75746 678 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMCC1O94876 653 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NKX2-2O95096 273 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LCKP06239 509 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CD63P08962 238 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CTPS1P17812 591 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MFAP4P55083 255 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SHBQ15464 509 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HSPB2Q16082 182 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADALQ6DHV7 355 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AAGABQ6PD74 315 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KBTBD6Q86V97 674 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AVL9Q8NBF6 648 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SGCDQ92629 289 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GCNAQ96QF7 691 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR2A14Q96R47 310 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FIZ1Q96SL8 496 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TOR3AQ9H497 397 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLK3Q9H4B4 646 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RABEP2Q9H5N1 569 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SETD4Q9NVD3 440 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ASB6Q9NWX5 421 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OGFRQ9NZT2 677 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HS6ST1O60243 411 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TBX10O75333 385 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNF8O76064 485 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TPPPO94811 219 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms