RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf99Q6UX52 265 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOB3CQ70IA8 216 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPOQ8IVL8 374 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTP4Q96DX8 246 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FIZ1Q96SL8 496 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GVM2 712 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS44E7EML9 344 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GUCY1B2O75343 617 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CH25HO95992 272 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCNAP12004 261 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC2A4P14672 509 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN2P17706 415 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRD5A1P18405 259 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU1F1P28069 291 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RYKP34925 604 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAS1P54826 345 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDAC4P56524 1084 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 BNC1Q01954 994 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 BIRC3Q13489 604 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESCO2Q56NI9 601 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CES5AQ6NT32 575 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM160B2Q86V87 743 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 AADATQ8N5Z0 425 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIB2Q92519 343 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELP4Q96EB1 424 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEMTQ9UBM1 199 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSF4Q9ULV5 492 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0U1RQF3 1178 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLSCR5A0PG75 271 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPB2A8KAH6 182 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTBD18B2RXH4 712 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 VNN2O95498 520 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF12P17014 697 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNTFP26441 200 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 FMO4P31512 558 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBA1BP68363 451 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFNB1P98172 346 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP4A11Q02928 519 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDGQ13569 410 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF6Q15052 776 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPB2Q16082 182 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFIL3Q16649 462 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A25Q6T423 547 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPXCR1Q8N123 301 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJC3Q8NFK1 279 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMO3Q8TAP4 145 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM160Q9NX00 188 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRN3Q9NYV6 651 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 LUZP4Q9P127 313 aa3.21□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0U1RQJ8 604 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND3A2RUS2 1198 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMTNL1A8MU46 457 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX22C9J3V5 150 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLRF2D3W0D1 207 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3KR12 359 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS11O94810 467 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R3DO95685 299 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms