RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 F11P03951 625 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CXCR5P32302 372 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PTGER3P43115 390 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN2P57739 230 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ACAT2Q9BWD1 397 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 THAP2Q9H0W7 228 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FBRSQ9HAH7 460 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SENP1Q9P0U3 644 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.48□□□□□ -1.69
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