RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PP2D1A8MPX8 630 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CASKO14936 926 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CRHR1P34998 444 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 AMPD2Q01433 879 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FOXM1Q08050 763 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DIRAS2Q96HU8 199 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MBOAT7Q96N66 472 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HOXA2O43364 376 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CCNB1P14635 433 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ARL10Q8N8L6 244 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FAM47BQ8NA70 645 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SERPINB11Q96P15 392 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GULP1Q9UBP9 304 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 C19orf81C9J6K1 198 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 RAB10P61026 200 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 KCNK18Q7Z418 384 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TDRPQ86YL5 185 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 POLIQ9UNA4 740 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 A0A087WZ62 844 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 AP5Z1O43299 807 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CALCAP01258 141 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TTPAP49638 278 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 LIPEQ05469 1076 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PON3Q15166 354 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF670Q9BS34 389 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PSMD11O00231 422 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CLPXO76031 633 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PRKD3O94806 890 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CCNDBP1O95273 360 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DNAJB1P25685 340 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 OR2B6P58173 313 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MYBPC3Q14896 1274 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ADAM32Q8TC27 787 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 C8orf37Q96NL8 207 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF446Q9NWS9 450 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MOSPD1Q9UJG1 213 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SLIT3O75094 1523 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 WDR27A2RRH5 827 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 FTH1P02794 183 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HIST1H2ABP04908 130 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MYBP10242 640 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 GRIA1P42261 906 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ALDH9A1P49189 494 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF45Q02386 682 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF543Q08ER8 600 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 PTPAQ15257 358 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 MOGQ16653 247 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SGO1Q5FBB7 561 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SPON2Q9BUD6 331 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 C1orf21Q9H246 121 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 SNX8Q9Y5X2 465 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 A0A0A0MRY4 1105 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ENTPD5O75356 428 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-202ENST00000334414 ZBED5Q49AG3 693 aa5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms