RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TAF4O00268 1085 aa10.64□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 SEMG2Q02383 582 aa10.64□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.64□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 TMLHEQ9NVH6 421 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 CLN6Q9NWW5 311 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.64□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 KANSL1LA0AUZ9 987 aa10.63□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 GNB5O14775 395 aa10.63□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.63□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa10.63□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.63□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.63□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 MYH3P11055 1940 aa10.63□□□□□ -0.71
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN9O75954 239 aa10.63□□□□□ -0.71
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