RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 GPR174Q9BXC1 333 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.39■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.39■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.37■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 BBS5Q8N3I7 341 aa20.37■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 THADAQ6YHU6 1953 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 PTPN3P26045 913 aa20.36■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SGK2Q9HBY8 427 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.36■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 H7C0C1 242 aa20.36■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 ITIH2P19823 946 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ABL2P42684 1182 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ATP5OP48047 213 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 AP1S1P61966 158 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ITKQ08881 620 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 GPS2Q13227 327 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 HDXQ7Z353 690 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 AGAP3Q96P47 875 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.36■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.35■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 SPINT1O43278 529 aa20.35■□□□□ 0.85
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RAB11B-201ENST00000328024 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 C11orf74Q86VG3 221 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 USP29Q9HBJ7 922 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11B-201ENST00000328024 AMACRQ9UHK6 382 aa20.35■□□□□ 0.85
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