RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD60Q9BZ19 345 aa25.51■■□□□ 1.68
SENP3-201ENST00000321337 IL1RL2Q9HB29 575 aa25.51■■□□□ 1.68
SENP3-201ENST00000321337 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa25.51■■□□□ 1.68
SENP3-201ENST00000321337 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
SENP3-201ENST00000321337 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
SENP3-201ENST00000321337 MRASO14807 208 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 UBDO15205 165 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 GRIA3P42263 894 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CLEC6AQ6EIG7 209 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 DUSP16Q9BY84 665 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SPAG4Q9NPE6 437 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 STAP1Q9ULZ2 295 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SBF1O95248 1867 aa25.51■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 C9JVG2 144 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 H0YJX3 145 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 AKAP10O43572 662 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 NPHS1O60500 1241 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TKTL1P51854 596 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K7CLP57077 242 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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SENP3-201ENST00000321337 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 RNF39Q9H2S5 420 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ATXN3LQ9H3M9 355 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 LRRC4Q9HBW1 653 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 HADHAP40939 763 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 STX5Q13190 355 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TTLL4Q14679 1199 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ZNF786Q8N393 782 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TFAP2CQ92754 450 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 PHF21BQ96EK2 531 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SLC2A13Q96QE2 648 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TRIM8Q9BZR9 551 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 MUC3BQ9H195 1237 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SMOXQ9NWM0 555 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SARDHQ9UL12 918 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 PIRO00625 290 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TPST1O60507 370 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CYHR1Q6ZMK1 362 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 IPMKQ8NFU5 416 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ISOC1Q96CN7 298 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 HDAC11Q96DB2 347 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SLC45A3Q96JT2 553 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 IGSF5Q9NSI5 407 aa25.5■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SCN4AP35499 1836 aa25.49■■□□□ 1.67
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SENP3-201ENST00000321337 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CUZD1Q86UP6 607 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 RETREG3Q86VR2 466 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 EPHX4Q8IUS5 362 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 BBS5Q8N3I7 341 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CBR4Q8N4T8 237 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 LZTR1Q8N653 840 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 APPL2Q8NEU8 664 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 LZICQ8WZA0 190 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TMEM181Q9P2C4 612 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 LRPAP1P30533 357 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 SQLEQ14534 574 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 EDEM1Q92611 657 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 DPF3Q92784 378 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.49■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.673e-6■■□□□ 12.5
SENP3-201ENST00000321337 CHRNA4P43681 627 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 STON2Q8WXE9 905 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 OLFM1Q99784 485 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 PIM2Q9P1W9 311 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 CROTQ9UKG9 612 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 AURKCQ9UQB9 309 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 ATP6V1G1O75348 118 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 COL6A2P12110 1019 aa25.48■■□□□ 1.67
SENP3-201ENST00000321337 NPR3P17342 541 aa25.48■■□□□ 1.67
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