RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TGDSO95455 350 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GSRP00390 522 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PRKCGP05129 697 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CKMP06732 381 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CR2P20023 1033 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CTNNB1P35222 781 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 BMPR1AP36894 532 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SLC1A2P43004 574 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CSRP3P50461 194 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TMPRSS15P98073 1019 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 MPP1Q00013 466 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CTBP1Q13363 440 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CYTH1Q15438 398 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 NEPROQ6NW34 567 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC14AQ86T13 490 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ACVR1CQ8NER5 493 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GCNAQ96QF7 691 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TRIB3Q96RU7 358 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 NPHS2Q9NP85 383 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SLC39A10Q9ULF5 831 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 RGRP47804 291 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 POLD2P49005 469 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 IRX4P78413 519 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ARF5P84085 180 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 BST1Q10588 318 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF470Q6ECI4 717 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0408Q6ZU52 694 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 OR13J1Q8NGT2 312 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CALML6Q8TD86 181 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 NOD2Q9HC29 1040 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM216Q9P0N5 145 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TLL1O43897 1013 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 FSBPO95073 299 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 NDST3O95803 873 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 C2P06681 752 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CES1P23141 567 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 OVGP1Q12889 678 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 LAMB3Q13751 1172 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 DLG2Q15700 870 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC153Q494R4 210 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 C7orf26Q96N11 449 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM55Q9BYV6 548 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO5Q9UKT4 447 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF510Q9Y2H8 683 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf71A6NGG8 1288 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 INSIG1O15503 277 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 LDB2O43679 373 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PFKLP17858 780 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 LIG3P49916 1009 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC15Q0P6D6 951 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 FSCBQ5H9T9 825 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PLPP4Q5VZY2 271 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 HTR3DQ70Z44 454 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ASAH2Q9NR71 780 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PRU2 124 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 HIDE1A8MVS5 230 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SLC7A4O43246 635 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ZMPSTE24O75844 475 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH3A1P30838 453 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CD151P48509 253 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT3Q14435 633 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PEX13Q92968 403 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CORO1BQ9BR76 489 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SCUBE2Q9NQ36 999 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP97Q9P2B7 532 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SLC12A4Q9UP95 1085 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 E2F8A0AVK6 867 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 UBOX5O94941 541 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 MYL4P12829 197 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GMPRP36959 345 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SCTRP47872 440 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SCNN1BP51168 640 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 USP10Q14694 798 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 PCLAFQ15004 111 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 GALNTL6Q49A17 601 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CPXM2Q8N436 756 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 FITM2Q8N6M3 262 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A17Q8WUG5 538 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 NUDCD1Q96RS6 583 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 OR51B4Q9Y5P0 310 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD8-201ENST00000313173 CCL16O15467 120 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SNAP91O60641 907 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SNNO75324 88 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CD160O95971 181 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 IRF9Q00978 393 aa27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms