RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 HSF2Q03933 536 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PRKCQQ04759 706 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ERAP2Q6P179 960 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 GK5Q6ZS86 529 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 AP3S1Q92572 193 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 EVPLQ92817 2033 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 NOTOA8MTQ0 251 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 FAM155BO75949 473 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 LHX1P48742 406 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 IDO1P14902 403 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CBX4O00257 560 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PRKAR1AP10644 381 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 TBC1D21Q8IYX1 336 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 OMDQ99983 421 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PIGUQ9H490 435 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 WNT7AO00755 349 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CDC42P60953 191 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MAGP20916 626 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PLCL1Q15111 1095 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 OR2T34Q8NGX1 318 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 OR2T3Q8NH03 318 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 Q96MT0 163 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 OPTCQ9UBM4 332 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 AREL1O15033 823 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 NRP2O60462 931 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 STX11O75558 287 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 STARD3Q14849 445 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ARHGEF6Q15052 776 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 BTBD9Q96Q07 612 aa10.27□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ZNF12P17014 697 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CASP7P55210 303 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 RPTORQ8N122 1335 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 LACTBL1A8MY62 500 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 USP17L7P0C7H9 530 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 NPR3P17342 541 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PTSQ03393 145 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MLXQ9UH92 298 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 VPS28Q9UK41 221 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 LINC00032P0C843 101 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SEPHS1P49903 392 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CARNMT1Q8N4J0 409 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SHC3Q92529 594 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 IL2P60568 153 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MAPKAPK3Q16644 382 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SH3BGRLO75368 114 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 E7ENX8 843 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 RAMP2O60895 175 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SHMT1P34896 483 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MTHFRP42898 656 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 HGFP14210 728 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 CCNCP24863 283 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 GPR15P49685 360 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SLC5A3P53794 718 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 TOR3AQ9H497 397 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 BTRCQ9Y297 605 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PSMA3P25788 255 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 IFNGR2P38484 337 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 VAT1Q99536 393 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 HSD3B7Q9H2F3 369 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 HAT1O14929 419 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 MPSTP25325 297 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 GRK3P35626 688 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 STAT5AP42229 794 aa10.26□□□□□ -0.77
TTL-201ENST00000233336 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms