RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM50BQ9Y247 325 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GBF1Q92538 1859 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LPXNO60711 386 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TYRP14679 529 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UGT1A6P19224 532 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UGT1A1P22309 533 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UGT1A4P22310 534 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TYK2P29597 1187 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UGT1A3P35503 534 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UGT1A5P35504 534 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FDFT1P37268 417 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MAGEA3P43357 314 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RHOAP61586 193 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CDH17Q12864 832 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ELMOD1Q8N336 334 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FGF13Q92913 245 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EID2BQ96D98 161 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IFT43Q96FT9 208 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SPTBP11277 2137 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRR23AA6NEV1 266 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DRGXA6NNA5 263 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SCAMP1O15126 338 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RFPL1O75677 317 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GLP2RO95838 553 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PACS1Q6VY07 963 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ACOX2Q99424 681 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TK2O00142 265 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OR1I1O60431 355 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRAMEF11O60813 436 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UGT2B4P06133 528 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TPSB2P20231 275 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EPHB1P54762 984 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 AIF1P55008 147 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KDSRQ06136 332 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RING1Q06587 406 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SEMA3AQ14563 771 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TPSAB1Q15661 275 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CEP97Q8IW35 865 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MZB1Q8WU39 189 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KXD1Q9BQD3 176 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NCAM2O15394 837 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRLP01236 227 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ITGA2BP08514 1039 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PTPN2P17706 415 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC1A2P43004 574 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PRPSAP1Q14558 356 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KDELC1Q6UW63 502 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ITIH5Q86UX2 942 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SCML4Q8N228 414 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GCNAQ96QF7 691 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FCRL5Q96RD9 977 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CASS4Q9NQ75 786 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CACNA1HO95180 2353 aa6.63□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms