RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000025301.3

AKAP11-201, Transcript of A-kinase anchoring protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKAP11, Length 9,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11-201ENST00000025301 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
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AKAP11-201ENST00000025301 IPMKQ8NFU5 416 aa4.54□□□□□ -1.68
AKAP11-201ENST00000025301 ACER1Q8TDN7 264 aa4.54□□□□□ -1.68
AKAP11-201ENST00000025301 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa4.54□□□□□ -1.68
AKAP11-201ENST00000025301 C10orf82Q8WW14 230 aa4.54□□□□□ -1.68
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AKAP11-201ENST00000025301 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.684e-7■■■□□ 14.6
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AKAP11-201ENST00000025301 FSTL1Q12841 308 aa4.53□□□□□ -1.68
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AKAP11-201ENST00000025301 NDUFA9Q16795 377 aa4.53□□□□□ -1.68
AKAP11-201ENST00000025301 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AKAP11-201ENST00000025301 IL23RQ5VWK5 629 aa4.53□□□□□ -1.68
AKAP11-201ENST00000025301 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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