RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641949.1

MFSD8-256, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-256	ENST00000641949	FNTB	P49356	437 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	SEMA3B	Q13214	749 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ENPP2	Q13822	863 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PDK2	Q15119	407 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	DLG2	Q15700	870 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PARP15	Q460N3	678 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	NLRP14	Q86W24	1093 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	LONP2	Q86WA8	852 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	LZTR1	Q8N653	840 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF366	Q8N895	744 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	KDM1B	Q8NB78	822 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	OR7D4	Q8NG98	312 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ALG14	Q96F25	216 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	DESI2	Q9BSY9	194 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM245	Q9H330	911 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	ALG6	Q9Y672	507 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MFSD8-256	ENST00000641949	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	LRRD1	A4D1F6	860 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	WASH4P	A8MWX3	477 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	TTC34	A8MYJ7	566 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	KRT86	O43790	486 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	SNAP91	O60641	907 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF217	O75362	1048 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	MT-CO1	P00395	513 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	COMT	P21964	271 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	PRKCH	P24723	683 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	HOXC13	P31276	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	SOX18	P35713	384 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ACVRL1	P37023	503 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	DNA2	P51530	1060 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	NDST2	P52849	883 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	TAS2R40	P59535	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	LINGO4	Q6UY18	593 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	CEP68	Q76N32	757 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	CCDC114	Q96M63	670 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	VPS51	Q9UID3	782 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RAB23	Q9ULC3	237 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949		R4GN57	208 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RASA4B	C9J798	803 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	DFFA	O00273	331 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	PJA2	O43164	708 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RASA4	O43374	803 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	KDELR3	O43731	214 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	DNTT	P04053	509 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	CCDC175	P0C221	793 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	GABRG2	P18507	467 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	GLDC	P23378	1020 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	KDELR1	P24390	212 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	SERPINB6	P35237	376 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MFSD8-256	ENST00000641949	DMWD	Q09019	674 aa		7.38	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms