RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641187.1

CASC19-217, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 875 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-217ENST00000641187 COL20A1Q9P218 1284 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 C5AR2Q9P296 337 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SALL1Q9NSC2 1324 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 NOTCH2Q04721 2471 aa3.13□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 A0A1W2PPL8 197 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 H3BNC9 293 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SEPT4O43236 478 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KLHL41O60662 606 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 TBCAO75347 108 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 USP1O94782 785 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PRSS23O95084 383 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 TUBB4AP04350 444 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 QDPRP09417 244 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 HMOX1P09601 288 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CSH1P0DML2 217 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CSH2P0DML3 217 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KITP10721 976 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 GZMAP12544 262 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CYBAP13498 195 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PLA2G2AP14555 144 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 IFNAR1P17181 557 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ABCD3P28288 659 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ICAM3P32942 547 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CIITAP33076 1130 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PRPHP41219 470 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 MSH2P43246 934 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CLCN5P51795 746 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SLC16A1P53985 500 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CACNA2D1P54289 1103 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RAD23AP54725 363 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RIPPLY3P57055 190 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RAP2BP61225 183 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 MC1RQ01726 317 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 OCA2Q04671 838 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 BFSP1Q12934 665 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CUL4BQ13620 913 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ADIPOQQ15848 244 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KYNUQ16719 465 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KDELC1Q6UW63 502 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 GPR142Q7Z601 462 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PXKQ7Z7A4 578 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SLFN11Q7Z7L1 901 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SPC24Q8NBT2 197 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 GDAP1Q8TB36 358 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SNX33Q8WV41 574 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 THAP4Q8WY91 577 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KAT5Q92993 513 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RGMAQ96B86 450 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 NACC2Q96BF6 587 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 EID2BQ96D98 161 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RNF31Q96EP0 1072 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CABS1Q96KC9 395 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 COG8Q96MW5 612 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PDE7BQ9NP56 450 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 DONSONQ9NYP3 566 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 SUN2Q9UH99 717 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 PRSS50Q9UI38 385 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.12□□□□□ -1.91
CASC19-217ENST00000641187 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms