RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZSCAN30Q86W11 494 aa16.45■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GULP1Q9UBP9 304 aa16.44■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DNAI1Q9UI46 699 aa16.44■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HPCAL4Q9UM19 191 aa16.44■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SCNN1AP37088 669 aa16.43■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ETFBP38117 255 aa16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDO1Q16878 200 aa16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF354CQ86Y25 554 aa16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.43■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARL13BQ3SXY8 428 aa16.42■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GDPD4Q6W3E5 623 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLPP6Q8IY26 295 aa16.42■□□□□ 0.22
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OR12D3Q9UGF7 316 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM59LQ9UK28 342 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATMQ13315 3056 aa16.42■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PES1O00541 588 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TM7SF2O76062 418 aa16.41■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GSRP00390 522 aa16.41■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CTSEP14091 401 aa16.41■□□□□ 0.22
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
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