RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611841.1

EP400-208, Transcript of E1A binding protein p400, human

TSL 5

Gene EP400, Length 3,129 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP400-208	ENST00000611841	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.63	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841		J3QRK9	145 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PMPCB	O75439	489 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	EPHA3	P29320	983 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CLCNKB	P51801	687 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CDH15	P55291	814 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CDKL1	Q00532	357 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CTBP1	Q13363	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	NRF1	Q16656	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MAVS	Q7Z434	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MGAM	O43451	1857 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TK2	O00142	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TRIM13	O60858	407 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	FYN	P06241	537 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	BDNF	P23560	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PSEN2	P49810	448 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	C21orf59	P57076	290 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ZNF460	Q14592	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MARK4	Q96L34	752 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SORT1	Q99523	831 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	RBBP8	Q99708	897 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841		H3BNX3	289 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	B3GAT3	O94766	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	LRIG2	O94898	1065 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	VAPB	O95292	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	AP2A1	O95782	977 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	GRM3	Q14832	879 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SMO	Q99835	787 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PTGES	O14684	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	DCLK1	O15075	740 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	POMC	P01189	267 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	AOC1	P19801	751 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MPST	P25325	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	NUDT2	P50583	147 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	DAOA	P59103	153 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TBCC	Q15814	346 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ADRM1	Q16186	407 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	PCSK7	Q16549	785 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	IL31	Q6EBC2	164 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.61	□□□□□ -0.55
EP400-208	ENST00000611841	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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