RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 SHROOM3Q8TF72 1996 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RAD51BO15315 384 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CREB3O43889 395 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 LRIG2O94898 1065 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ANXA6P08133 673 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 EPHB2P29323 1055 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ABL2P42684 1182 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 PTPN9P43378 593 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 NR0B2Q15466 257 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 MYLK3Q32MK0 819 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC14Q49A88 953 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 FAXCQ5TGI0 409 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 PLPP6Q8IY26 295 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 SLC39A7Q92504 469 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 BMFQ96LC9 184 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 EPAS1Q99814 870 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 THSD1Q9NS62 852 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 C2CD4BA6NLJ0 364 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 MUSKO15146 869 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 KDELR3O43731 214 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TM7SF2O76062 418 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TMCC1O94876 653 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 GJB6O95452 261 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CTSEP14091 401 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 KLK7P49862 253 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 UCNP55089 124 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 FMO1Q01740 532 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 FGL2Q14314 439 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RAB6CQ53S08 254 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 BNIPLQ7Z465 357 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC185Q8N715 623 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ASB12Q8WXK4 309 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 GANQ9H2C0 597 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 PRORYQ9H606 182 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 GGT7Q9UJ14 662 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 FAM72CH0Y354 149 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 MMP20O60882 483 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC172P0C7W6 258 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 HTR1BP28222 390 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 LSSP48449 732 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 BLKP51451 505 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 HDAC4P56524 1084 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TMPRSS3P57727 454 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 YPEL5P62699 121 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 PPARDQ03181 441 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 TLE3Q04726 772 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-205ENST00000596282 ELP6Q0PNE2 266 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms