RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 ZNF653Q96CK0 615 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 LRRC19Q9H756 370 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 DKK3Q9UBP4 350 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 CA5BQ9Y2D0 317 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 AKAP13Q12802 2813 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 FRYQ5TBA9 3013 aa18.28■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 A6NNZ2 444 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 NEMP1O14524 444 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 UGT2B4P06133 528 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 MIPP30301 263 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 GKP32189 559 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 HCAR3P49019 387 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 SUOXP51687 545 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 HCAR2Q8TDS4 363 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 VOPP1Q96AW1 172 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 MYOCQ99972 504 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 KLC2Q9H0B6 622 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-209ENST00000591387 ACACAQ13085 2346 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 AREL1O15033 823 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 DAPK3O43293 454 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PCK1P35558 622 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ABL2P42684 1182 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ZBED6P86452 979 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ILKQ13418 452 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 HGSNATQ68CP4 663 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 TTC7BQ86TV6 843 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 OR13H1Q8NG92 308 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 TSC1Q92574 1164 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 BMFQ96LC9 184 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CALN1Q9BXU9 219 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 FZD3Q9NPG1 666 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PRAMEF11O60813 436 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 LRCH4O75427 683 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 SERPING1P05155 500 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 RABIFP47224 123 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CLDN2P57739 230 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 FGL2Q14314 439 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CYTH1Q15438 398 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CA9Q16790 459 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 BOLA3Q53S33 107 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 Q6ZSR6 202 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 RFX8Q6ZV50 586 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 TMPRSS12Q86WS5 348 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 DNAAF5Q86Y56 855 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PEBP4Q96S96 227 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 TRIM7Q9C029 511 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PDFQ9HBH1 243 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 GPR27Q9NS67 375 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 LHX3Q9UBR4 397 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 IGLON5A6NGN9 336 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 FPGTO14772 594 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 RFPL3O75679 317 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CAPNS1P04632 268 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CKMT2P17540 419 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ERCC2P18074 760 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CSNK1DP48730 415 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 HS1BP3Q53T59 392 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 AFMIDQ63HM1 303 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 SLC25A45Q8N413 288 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 LZTR1Q8N653 840 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.519e-8■■■□□ 16.5
CTIF-209ENST00000591387 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ZWILCHQ9H900 591 aa18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 POM121BA6NF01 834 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-209ENST00000591387 NEMP2A6NFY4 417 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms