RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CALML6Q8TD86 181 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CASP10Q92851 521 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PEX13Q92968 403 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SPATA17Q96L03 361 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 MECRQ9BV79 373 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 MRGBPQ9NV56 204 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 MCM8Q9UJA3 840 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TLK1Q9UKI8 766 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PSAT1Q9Y617 370 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A087X1B8 175 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1W2PQH9 124 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HEATR9A2RTY3 570 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 DRGXA6NNA5 263 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 H7C4K7 107 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 DFFAO00273 331 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM13O60858 407 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NEBLO76041 1014 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 C2P06681 752 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HSD3B2P26439 372 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC26A3P40879 764 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 MAPKAPK2P49137 400 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TBX4P57082 545 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC12A1Q13621 1099 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC14A2Q15849 920 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PARP15Q460N3 678 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 FSCBQ5H9T9 825 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CES4AQ5XG92 561 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF280DQ6N043 979 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 RANBP10Q6VN20 620 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TEX26Q8N6G2 289 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TEX9Q8N6V9 391 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 VPS39Q96JC1 886 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM209Q96SK2 561 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 MIPEPQ99797 713 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SIK2Q9H0K1 926 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TREX1Q9NSU2 369 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SRRDQ9UH36 339 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIP11Q15643 1979 aa7.28□□□□□ -1.24
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms