RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 BIRC5O15392 142 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ANXA5P08758 320 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 BROXQ5VW32 411 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GAD1Q99259 594 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 BTRCQ9Y297 605 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 MEIS2O14770 477 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 AKIRIN2Q53H80 203 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA4P29622 427 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 DET1Q7L5Y6 550 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SEC24AO95486 1093 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ITGA2BP08514 1039 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TFEBP19484 476 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GJA8P48165 433 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 UMPSP11172 480 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2C18P33260 490 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42P60953 191 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN8P19075 237 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GABRB2P47870 512 aa21.52■■□□□ 1.04
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PTPRM-211ENST00000580170 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 PTSQ03393 145 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 COMMD2Q86X83 199 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ENTPD4Q9Y227 616 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 MLYCDO95822 493 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 GOT1P17174 413 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R40P59535 323 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 DACT2Q5SW24 774 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 NOMO3P69849 1222 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF670Q9BS34 389 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-211ENST00000580170 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MTA2O94776 668 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 AKR1A1P14550 325 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 LGALS3BPQ08380 585 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SHC3Q92529 594 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ADI1Q9BV57 179 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CCNA2P20248 432 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SRP54P61011 504 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 UTS2BQ765I0 119 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 AK5Q9Y6K8 562 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GCNT7Q6ZNI0 430 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 FZD1Q9UP38 647 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC182A6NF36 153 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRM-211ENST00000580170 AVILO75366 819 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ADSSP30520 456 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ABL2P42684 1182 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 LIPMQ5VYY2 423 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 TTC23Q5W5X9 447 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 ASB8Q9H765 288 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 NTRK1P04629 796 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 SCNN1GP51170 649 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-211ENST00000580170 IRF8Q02556 426 aa21.51■■□□□ 1.03
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