RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	ALG6	Q9Y672	507 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	LNP1	A1A4G5	178 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CCDC66	A2RUB6	948 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NEMP1	O14524	444 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	YKT6	O15498	198 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ARHGAP6	O43182	974 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CTSL	P07711	333 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ADRB3	P13945	408 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TCF4	P15884	667 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	COMT	P21964	271 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	IL4R	P24394	825 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NUMB	P49757	651 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	C21orf59	P57076	290 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	COPS2	P61201	443 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GALNT2	Q10471	571 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ERAP2	Q6P179	960 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NPW	Q8N729	165 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PAF1	Q8N7H5	531 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CHST14	Q8NCH0	376 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TSGA13	Q96PP4	275 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RNF157	Q96PX1	679 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CD93	Q9NPY3	652 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150		J3KR12	359 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	APOL1	O14791	398 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KRT1	P04264	644 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TAS2R40	P59535	323 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	IRX4	P78413	519 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	BCL2L1	Q07817	233 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PDK1	Q15118	436 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	HORMAD1	Q86X24	394 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	OXR1	Q8N573	874 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DEFB119	Q8N690	84 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ASB12	Q8WXK4	309 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SPOCK2	Q92563	424 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	EML5	Q05BV3	1969 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	VILL	O15195	856 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	MTSS1	O43312	755 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	KRT86	O43790	486 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	MAFK	O60675	156 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	OPHN1	O60890	802 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SOCS5	O75159	536 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PCDH8	O95206	1070 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	UGT2B4	P06133	528 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	IGHV4-34	P06331	123 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF883	P0CG24	379 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	ENG	P17813	658 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	AKT2	P31751	481 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	MMP13	P45452	471 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SGCG	Q13326	291 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	STAT4	Q14765	748 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CYTH1	Q15438	398 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	INAVA	Q3KP66	663 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	STPG1	Q5TH74	334 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SRL	Q86TD4	932 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TTC7B	Q86TV6	843 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	EXD1	Q8NHP7	514 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	HDAC11	Q96DB2	347 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SERAC1	Q96JX3	654 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	LHX3	Q9UBR4	397 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PKD1-238	ENST00000570150	CFAP69	A5D8W1	941 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PKD1-238	ENST00000570150	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PKD1-238	ENST00000570150	C10orf142	B7Z368	130 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PKD1-238	ENST00000570150	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PKD1-238	ENST00000570150	TOR1B	O14657	336 aa		18.2	■□□□□ 0.5

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