RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ADGRF1	Q5T601	910 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	USP53	Q70EK8	1073 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	BNIPL	Q7Z465	357 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	MFN1	Q8IWA4	741 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	OXR1	Q8N573	874 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	OR13H1	Q8NG92	308 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TTC17	Q96AE7	1141 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SLC39A13	Q96H72	371 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	MCEE	Q96PE7	176 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CALN1	Q9BXU9	219 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	DDIT4	Q9NX09	232 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		14.11	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	BLACE	A4D250	179 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222		M0QYT0	321 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ENDOD1	O94919	500 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PDGFRA	P16234	1089 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PTPN9	P43378	593 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SULT1E1	P49888	294 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ST8SIA6	P61647	398 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CNTN1	Q12860	1018 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TBR1	Q16650	682 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CCDC14	Q49A88	953 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	H2AFV	Q71UI9	128 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TBCB	Q99426	244 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	EPN3	Q9H201	632 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	KLF15	Q9UIH9	416 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SCML1	Q9UN30	329 aa		14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	NDUFA10	O95299	355 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	F9	P00740	461 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	GPD1	P21695	349 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SDC4	P31431	198 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TAS2R38	P59533	333 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	NME3	Q13232	169 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	E2F5	Q15329	346 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	CNPY3	Q9BT09	278 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	PIGV	Q9NUD9	493 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	TMEM51	Q9NW97	253 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	INTU	Q9ULD6	942 aa		14.09	□□□□□ -0.15
CS-231	ENST00000552222	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	LATS1	O95835	1130 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	TMEM253	P0C7T8	217 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	SLC2A3	P11169	496 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	C5AR1	P21730	350 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	SLC5A2	P31639	672 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	CCR1	P32246	355 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	CXCR3	P49682	368 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	ATP11A	P98196	1134 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	OGDH	Q02218	1023 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	DEUP1	Q05D60	604 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	SPA17	Q15506	151 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-231	ENST00000552222	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16

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